菲律賓當局星期二（5月31日）表示，已就中國單方面宣布南中國海禁漁令提出外交抗議，並抱怨中國海警船騷擾菲律賓船違反菲律賓的管轄權。
據路透社報道，菲律賓外交部在一個聲明中指責中國船隻在菲律賓專屬經濟區（EEZ）內兩個地點，擾亂菲律賓一個聯合海事科研使命和能源鑽探。
菲律賓外交部說，中國海警的行為不符合無害通行，是對菲律賓海上管轄權的明顯違犯。
菲律賓外交部還在另一個聲明中譴責中國在南中國海實行的年度夏季休漁期。這個休漁期的範圍包括越南和菲律賓專屬經濟區內的海域。不過，菲律賓外交部沒有解釋為何等待了一個月才提出抗議。中國的年度夏季休漁期今年始於5月1日，到8月16日結束。
報道說，中國駐馬尼拉大使館沒有立即回應對菲律賓聲明進行置評的請求。
菲律賓外交部的抗議突顯了當選總統小費迪南德·馬科斯未來所面臨的挑戰。他將不得不在謀求與中國更緊密的經濟關係的同時，避免在軍方指責的北京非法海上挑釁問題上屈服於中國。
分析普遍表示，小馬科斯在美中之間將對北京更有善意。不過，他上週在他迄今最強硬的外交評論中表示，他將捍衛主權領土，並抵抗中國的侵蝕。此前，他在與中共領導人習近平的通話中說，他將會努力把菲中雙邊關係提升到一個新水平。
另據美聯社報道，菲律賓外交部的聲明說，中國的南中國海休漁期不只限制中國的漁船，違反了荷蘭海牙常設仲裁法院2016年7月做出了有利於馬尼拉的裁決。
該裁決認定中國傳統上對南中國海多數海域宣稱擁有主權的“九段線“主張在國際法下沒有效力。而菲律賓在200海裡專屬經濟區（EEZ）範圍內，有權利用天然資源。
中國對這個仲裁結果不予理睬。而隨後上任的菲律賓總統杜特爾特為了不得罪北京，獲得數十億美元的中國投資，選擇了不堅持這一裁決。
高票當選總統的小費迪南德·馬科斯5月26號表示，他將維護國際仲裁法庭對南中國海主權爭議的裁決，不會允許中國“踐踏”菲律賓在南中國海的權利。
菲律賓和中國在南中國海的幾個區域存在爭議。南中國海爭端是馬尼拉與北京關係的一個主要絆腳石。
除中國宣稱對南中國海多數海域擁有主權外，菲律賓、越南、馬來西亞、文萊、台灣等也宣稱擁有部分主權。南中國海是全球重要的貿易通道，每年有至少2.4萬億美元的貿易商品通過南中國海轉運。
