中國與梵蒂岡簽署主教任命臨時協議之後，台灣政府強調台梵關係依然相當穩定，不過，台灣前總統陳水扁則表示，中梵可能在今年年底之前建交。
挖台牆腳
台灣外交部發言人李憲章星期二(9月25號)表示，中國最重要目的就是挖台灣牆腳，不管在任何區塊，這是中國一直沒有放棄打壓台灣的做法。
他說：“所以我們對任何可能影響與邦交國之間的關係，任何外在勢力的干預、干擾，我們都會密切注意、盡力防範，而且透過雙邊合作機制強化和所有邦交國的合作。”
李憲章還說，台灣天主教主教團今年5月才到教廷跟教宗述職，台灣政府10月中旬還將派團前往梵蒂岡參加先教宗保祿六世(Pope Paul VI)的封聖典禮。
李憲章強調，教廷方面也一再向台灣重申，與中國達成的主教任命臨時協議，無涉政治及外交的意涵，也不會影響台梵之間的邦誼。
年底建交
不過，台灣前總統陳水扁透過臉書表示，有消息來源透露，中國和梵蒂岡將在年底之前完成建交，他希望這不是真的，儘管外交部樂觀地說台梵邦交不會有問題，10月還有台灣訪問團要過去，但是不要忘記台灣與查德斷交是在前行政院長蘇貞昌打算前往訪問的22小時前。
陳水扁還指出，中梵建交最大障礙就是主教任命的問題，一旦獲得解決，建交當然也就快了，他很擔心台灣年底地方選舉之前將會發生，這會使得民進黨的選情雪上加霜。
陳水扁還認為，梵蒂岡深具國際影響力，是台灣僅存的17個邦交國當中最重要的一個，也是在歐洲的唯一邦交國，北京很清楚，挖走梵蒂岡，將對台灣外交帶來重大衝擊。
有可信度
台灣文化大學政治系講座教授陳一新接受美國之音採訪表示，陳水扁擔任過總統，相信他的消息來源有一定的可信度。
他說：“當然是不是在年底或是選前會出現這樣的局面，大家都不希望那麼早，以台灣立場來講，能拖多久，就拖多久，但是既然(中梵)主教任命協定達成了，顯示雙方隨時可以建交，因為巨大的障礙已經移除。”
陳一新教授還說，中國大陸現在已經不太在意台灣藍綠政黨的感受，以前可能還會考慮藍軍的立場，現在則是以自己的利益為主要考量，例如自行出台一些對台灣民眾有利的優惠措施等。
關係穩定
台灣總統府發言人黃重諺表示，台灣與梵蒂岡分享共同的價值，在民主人權及宗教自由上有很多共同點，也有許多共識，兩國關係相當穩定。
黃重諺還說，從人權的普世角度來看，如果在梵蒂岡的努力之下，中國人民因此可以領受更多來自於天主的慈愛，享有更多的宗教自由，這是應該受到祝福的好事。
