台灣務實地加強與現有邦交國關係的同時，有智庫分析了台灣巴拿馬斷交後台灣的外交前景，以及影響台灣國際空間的兩岸關係變化。有學者說，“中華民國”名號勢必會被“台灣國”取代，台海就此對決不可避免。
巴拿馬與台灣斷交後，台灣似乎加強與現有邦交國的關係。 6月20日一天，外交部就發佈了兩則這方面消息。洪都拉斯副總統即日起訪問台灣，並說，與洪都拉斯“邦誼篤睦”。另外，布基納法索國會友台小組主席已抵台訪問，此人“熱心推動台佈國會交流”。
6月20日，新台灣國策智庫公佈名為“國人對巴拿馬斷交與台灣國家定位看法”民調。
談到民調的主要指標，智庫執行長陳致中對美國之音說：“多數的民意贊成，台灣和中國是兩個國家。當然，國內有人認為是台灣，有人認為是ROC中華民國，這是另外一個問題。對於政府所謂維持現狀的政策，65%的民眾認為要調整。是往一個中國方向調整，還是往台灣主體路線，也就是一邊一國的方向調整？我們沒有結論，大家可以思考。”
陳致中是前總統陳水扁的兒子，記者問陳水扁對巴台斷交事件的看法。
陳致中說：“他（陳水扁）沒有特別講對這個事情的看法。當然我想，每個台灣人都關心台灣的前途，這是台灣未來何去何從的問題。”
這項調查顯示，51.5%的台灣民眾擔心，其他邦交國會陸續與台灣斷交，不擔心的佔41.9%。民調還顯示，58.7%的台灣民眾認為，巴台斷交對兩岸關係有負面影響；認為有正面影響的為19.3%；支持蔡英文就斷交事件所發聲明的為46.6%， 不支持的為39.5 %。
成功大學政治系副教授蒙志成說，台巴斷交後民眾中出現所謂“撼獨” 現象。
他說﹕“台巴斷交遏制或者震撼了民眾想要獨立的想法，民眾不敢講出來，遏制了他們的聲音。但是趨統的也很有限，幾乎在統計誤差當中。這樣的一個結果表明，即便有所謂'撼獨'，但是卻加強了台灣人民對對岸政府的敵意。形式上或許不再喊獨，可是實質上，內心上，已經跟你對岸不是一個國家，這樣一個效應是這次調查當中比較重要的發現。”
前立委林世嘉說，台灣年輕族群或許將決定台灣未來的主體意識方向。
她說﹕“四十歲以上的，就像我們這些人，我們小時候，念的地理都是長江黃河，西起哪裡，東至哪裡，等等的教育世代，和20至39歲的群體比較，他們有很大的差異。我覺得比例太高了很難逆轉。他們在公共議題和國家認同上就很強烈。這些'天然毒'我們把它定義出來是在太陽花學運之後。”
林世嘉說，所有政黨、所有兩岸領導人，都不能忽略這個趨勢，愈年輕的，台灣認同愈強。
針對有輿論說，假如台灣“中華民國”的邦交國斷光光，那時“台灣國”倒是可以出現。對此，新台灣國策智庫研發長李明峻首先提出一個法律問題。
他說﹕“目前的邦交國，就是承認中華民國的國家。承認中華民國是指中華民國代表中國，所以現在和我們建交的20個邦交國，如果從法律上來解釋的話，是指蔡英文是統治十三億人的總統。這個當然跟國際社會現實非常不符，是很畸形的狀況。”
不過，李明峻說，隨著台灣年輕世代的成長，逐漸成為台灣社會主體，中華民國這個圖騰將消失，上面的法律問題或許不在。
他說：“緩衝劑的中華民國愈來愈縮減的狀況，未來造成中國和台灣國直接對決的一天會出現。你們大家都很清楚，這是中國的困境，也是台灣的困境，甚至也是國際社會的困境。 ”
上述民調是由台灣趨勢民意調查股份有限公司6月17日至18日完成，調查對像是20歲以上的台灣民眾，完成樣本953份，抽樣誤差正負3.2%。
國立台灣大學國家發展研究所法學博士曾建元在《綠營智庫在兩岸關係中的作用》一文中說，新台灣國策智庫在民進黨內並沒有特定的派系色彩，其影響力除辜寬敏個人聲望外，最主要來自其研究上的表現。
