台灣總統府國安會星期四向立法會提交的一份書面報告表示，中國大陸與南韓自由貿易協議已經完成13回合談判，對台灣產業構成嚴重威脅。報告指出，政府希望兩岸協議監督條例能夠早日完成審議，使兩岸貿易協議能及時通過。
報告說，兩岸互動頻繁當然也有潛在的國安風險，國安會將秉承憲法及相關法律賦予的職責，追求兩岸關係機會極大化，風險極小化，確保台海和平穩定。
中國國家主席習近平今年7月訪問首爾期間與南韓總統朴槿惠共同宣布，力爭於年底簽署中韓自由貿易協定。馬英九總統曾經表示，一旦中韓簽署FTA，一定會影響台灣在大陸的市場佔有率，拉大台灣與南韓的差距，令他“心急如焚”。
台灣中華經濟研究院WTO中心副執行長李淳認為，台灣與南韓出口產品類別相同，中韓自由貿易協定將重創台灣在大陸的市場份額。
“因為就製造業的出口來看，我們跟南韓在產品類別上大概有百分之50，有人說高達百分之80是重疊的。也就是說，凡是在海外市場多買一個南韓產品，那就可能少買一個台灣產品。這種替代關係會讓我們認為，韓國如果在某個市場取得一定優勢，台灣就會特別擔心。”
2008年國民黨取代民進黨成為執政黨後，兩岸經貿關係進展迅速，於兩年後的2010年便簽署了兩岸經濟合作結構協議（ECFA），接下來的兩岸服貿協議也於2013年六月簽署。如果按照正常程序，兩岸這些經貿協議原本可望在中韓簽署FTA之前實施，但今年3月爆發的太陽花學運中斷了服貿協議在立法院的審議，兩岸貨貿協議談判陷於停滯。
台灣經濟學家李淳說，台灣產品原本在大陸市場上的優勢，可能將面臨南韓低關稅的鯨吞，從而削弱國家的經濟實力。
“我們可以看到台灣在過去幾年每年對大陸的貿易順差都在900億美元左右，是台灣目前最主要的貿易順差來源。如果這個貿易順差來源因為FTA的原因受到南韓的侵蝕，貿易順差開始降低，那就會反映在台灣整體貿易的表現。”
但是東吳大學政治系副教授吳誌中認為，馬英九政府和台灣業界一些人士誇大了台灣和南韓出口產品的重疊性以及中國市場的重要性，目的是加快與北京融合的步伐。
“國安會之所以要做這樣一個報告，基本上是馬英九政府要讓台灣產業更加快速與中國結合，這是他執政以來的一個主要目標。我們都知道太陽花學運阻擋了服貿協議，現在又在談貨貿協議。現在我們的政府就是越來越多地以中韓FTA為藉口，讓台灣加速與中國的產業結合。”
同時兼任台獨團體台灣社秘書長的吳誌中教授進一步指出，中國企圖在經濟上拉攏台灣，然後以經逼政的戰略是盡人皆知的，台灣必須要警惕。
“台灣過度依賴中國，對於台灣的安全是有害的。所以在這種情況下，我們跟中國維持適當的經貿關係是必要的，但是不能過於深入。”
面對服貿及貨貿協議將導致台灣經濟嚴重依賴中國大陸的指責，馬英九總統說，台灣做不到不依賴中國大陸，因為美國推動打造的泛太平洋自由貿易區中，有7個國家都以中國大陸作為第一大貿易夥伴。大陸有市場，有生產力，自然有人要同他做生意。馬英九說，無謂的耽擱，只會把機會平白浪費，而繼續內鬥，鬥垮的不是國民黨，而是台灣經濟。
