以色列警方星期三（4月5日）一早衝入位於耶路撒冷舊城聖殿山的阿克薩清真寺，並向聚集在清真寺內外的巴勒斯坦年輕人投擲震撼手榴彈，而巴勒斯坦年輕人則投擲石塊和鞭炮反擊。加沙的巴勒斯坦武裝分子用火箭襲擊以色列南部地區加以回應，導致以色列頻頻發動空襲作為報復。
此次衝突由於發生在巴勒斯坦人和猶太人兩大節日正在進行或開始之際，因此令人擔心流血暴力有可能進一步全面升級。穆斯林正在慶祝齋月節(Ramadan)，而猶太人將於星期三晚間開始慶祝逾越節 (Passover)。
阿克薩清真寺所在的舊城聖殿山對猶太人和巴勒斯坦人而言都是聖地。阿克薩清真寺是穆斯林的第三大聖地，通常在齋節期間都會擠滿朝拜者。而對於猶太人而言，聖殿山也是猶太教最神聖的地方，猶太人的耶路撒冷聖殿就位於此處。猶太人和巴勒斯坦人有關聖殿山的爭議過去曾多次引爆流血衝突，最近的一次衝突就是以色列與治理加沙的哈馬斯武裝分子之間延續11天的戰爭。
自從齋節3月22日開始以來，許多穆斯林崇拜者一再試圖在清真寺過夜，而這一情況通常會在齋月的最後十天才能獲得允許。以色列警方每天晚上都會進入清真寺將寺內的人群驅離，這就常常與希望留在寺內一直禱告到天明的巴勒斯坦年輕人發生衝突。
由於猶太人中的極端民族主義分子呼籲在聖殿山清真寺的場地舉行模仿古時在逾越節宰羊祭祀的活動，此舉更是給警方與留守清真寺的巴勒斯坦年輕人之間的衝突火上澆油。以色列政府禁止在聖殿山清真寺的場地進行宰羊祭祀的儀式或活動，但是猶太人極端分子的呼籲讓巴勒斯坦人擔心以色列正在圖謀控制清真寺的場地。
星期二晚間，在大約八萬巴勒斯坦人在清真寺參加禱告活動之後，好幾百年輕人把自己封閉在清真寺內繼續進行通宵達旦的禱告。其中一些人表示，他們決定在清真寺內堅守，以防止猶太人在清真寺場地上進行宰羊祭祀活動。在這些年輕人一再拒絕離開之後，警方便破門進入清真寺，並使用警棍襲擊了清真寺內的巴勒斯坦人。
以色列警方表示，“有幾位違法的年輕人和戴著面具的鼓動者”將鞭炮、棍棒和石塊帶進了清真寺，高呼侮辱性的口號，並將清真寺的大門反鎖。
“在多次和長時間勸說無效之後，警方被迫進入清真寺場地，”美聯社引述警方的話說。警方還表示，一位警察腿部受傷，而大約350名巴勒斯坦人被逮捕。被釋放的巴勒斯坦人則表示，他們獲釋有一個條件，那就是在未來一個星期不能再進入清真寺或清真寺所在的舊城。
據美聯社報導，截至星期三早晨，聖殿山的衝突已經逐漸平息。一位不願具名的巴勒斯坦官員告訴美聯社，巴勒斯坦執政當局已經在和埃及、約旦、美國以及聯合國官員進行聯絡，希望降低當地的緊張局勢。
美聯社引述巴勒斯坦紅新月會的話說，暴力事件導致50人受傷。以色列軍方則表示，在被佔領的西岸，有一位以色列士兵遭到槍擊。
美聯社表示，大批巴勒斯坦人聚集在耶路撒冷一處警察局的周圍，著急地等待他們被捕的親人被釋放，許多被捕的人襯衣上沾滿了鮮血，還有些人的腿上綁著繃帶，一瘸一拐地走出拘留所。
從拘留所中被釋放的人指責警方使用警棍、椅子以及其他他們伸手可得的東西毆打包括婦女和兒童在內的巴勒斯坦人。而巴勒斯坦人也通過施放鞭炮或投擲石塊作為反擊。在清真寺門口，警察使用震撼手榴彈和橡皮子彈驅離聚集在那裡的年輕人。
美聯社說，以色列警方表示，他們無法立即證實有關警方毆打巴勒斯坦人的報導或視頻。
接受美聯社採訪的一位來自東耶路撒冷的19歲男青年阿明·里舍奇（Amin Risheq），掀起自己血跡斑斑的襯衣，向他的媽媽展示他被打得又青又紫的後背以及纏著繃帶的胳膊。他說，他曾被一枚催淚彈的彈體擊中，後來被警方毆打後又被強迫與其他幾十位其他人一起躺在清真寺的地上，而且雙手還被綁在身後。這位年輕人表示，他被押往警察局之後，在超過六個小時中，沒有被允許上廁所、接受醫療照顧或喝水。
“他們把我們當牲口，”這位年輕人說。
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