台灣行政院成立禽流感災害應變中心，調動各部門力量，全力應對疫情嚴重的H5N6禽流感病毒的擴大。與此同時，行政院長林全呼籲民眾不要恐慌，同時也不能輕忽禽流感傳染人類的可能性。
台灣行政院禽流感中央災害應變中心第一次會議星期一下午在防檢局召開。行政院長林全就目前H5N6禽流感的疫情以及目前行政院採取的應對措施做了介紹。
林全說：“我們希望中央、各部會和地方政府能夠通力合作，持續地加強各項有關防疫措施和準備，同時也要請地方政府能夠確實掌握疫情動態，充分地掌握資訊是我們在疫情防禦上第一項非常重要的基本工作。”
林全強調，H5N6禽流感曾經在中國大陸發生過“禽傳人”的案例，台灣絕不能對這次疫情輕估，不過，禽傳人的情況在日本和韓國還沒有發現。他希望衛福部和農委會要加強教育和宣導工作，一方面避免民眾過度恐慌，另一方面也不能掉以輕心，因為禽傳人的可能性的確存在。
林全還表示，防疫就如同作戰，在這場防疫禽流感疫情的作戰中，前線和後勤要相互配合，根據這兩天疫情發展的情況，要將疫情作戰視為全國的作戰。他期許在前線和後勤作戰的每一位同仁都要做好每個細節，才能達到打贏這場防疫禽流感的戰役。
今年2月以來，台灣的花蓮縣、台南市相繼出現H5N6的禽流感疫情，13日嘉義縣也發現了H5N6禽流感疫情。據信，這次H5N6禽流感病毒是從日本和南韓通過候鳥帶到台灣。
農曆新年過後剛剛接任農委會主委的前宜蘭縣長林聰賢說，目前已經確認台南和花蓮的6家養雞場發生H5N6禽流感疫情，星期一中午剛剛確認嘉義縣也發生H5N6的禽流感疫情。他說，中央和地方政府已經採取應對措施，禁止疫區的家禽外流，防止H5N6禽流感疫情的蔓延和擴散。
他說：“對於相關的防疫準備，我們原來在台東、花蓮和宜蘭都有做了攔檢站，在台南採取了部分場地的管控，今天嘉義又發生了禽流感疫情，我們希望能進一步擴大管控的措施。”
擔任這次禽流感疫情指揮官的林聰賢說，為了統籌各部會應對禽流感的努力，專門成立了跨部會人員組成的疫情控制組、產業輔導組、民生經濟組等機構。同時，他也表示，嘉義出現的禽流感疫情發生在地下屠宰場，各地政府和警政部門將全力打擊非法的地下屠宰場。
據台灣媒體統計的資料，截止到上個星期，台灣今年已經撲殺大約12萬隻家禽，其中大多數是對人體較無危害的H5N2和H5N8。不過，最近陸續出現的H5N6禽流感病毒，具有高傳播率，高致病率和致死率。台南3千多只火雞日前感染了H5N6禽流感病毒。
