教宗是對中東進行第三天、也是最後一天訪問時發出這一呼籲的。他參觀了圓頂清真寺。這座清真寺坐落在伊斯蘭教視為第三聖地的耶路撒冷。穆斯林相信先知穆罕默德就是在耶路撒冷升天的。
教宗說,他在這個聖地由衷地請求所有的人,願我們像兄弟姐妹般地互尊、互愛。願我們學會理解他人的痛苦!願沒有人濫用上帝之名使用暴力!願我們一起為正義与和平而努力!
教宗還訪問了西牆,他在那裡低頭祈禱了幾分鐘。西牆是聖經所載第二座聖殿的唯一遺跡,也是猶太人心目中最神聖的祈禱地點。
教宗隨後會晤以色列總理內塔尼亞胡和總統佩雷斯,然後在基督徒相信耶穌與門徒共進最後晚餐的馬可樓舉行彌撒。錫安山也被穆斯林和猶太人尊為聖地,他們認為大衛就被安葬在這裡。
教宗方濟各在訪問了約旦之後抵達耶路撒冷,然後直接乘直升機前往西岸。前任教宗都是在首先訪問以色列的特拉維夫之後前往西岸。方濟各的訪問安排被看作是對巴勒斯坦成立自己國家願望的象征性認同。