台灣在禁止進口含有瘦肉精的美國肉類方面，繼續堅持現行標準和法規。有輿論稱，台美相互挑戰對方法律。有關專家認為，這個問題牽涉面很大，不大可能輕易解決。
台灣外交部發言人章計平4月14號說，台灣目前堅持的現行法規有科學根據：“針對美方所提出來的一些狀況，我們(台灣)方面認為，台灣在美牛協議裡面都載明，需要依據我們(台灣)國內既有的規範。”
報導顯示，台灣內部在瘦肉精問題上目前尚無共識，短期內似乎不大可能有所突破。章計平說，國際食品法典委員會(Codex)7月將討論瘦肉精規範問題，台灣外交部屆時會將相關資訊提供給台灣國內參考。這似乎是說，台灣在瘦肉精標準方面今年夏天不大可能有重大改變。
*台灣官方﹕雙邊關係不會受影響*
章計平還說，台灣將持續同美國就瘦肉精問題保持溝通。他強調，瘦肉精涉及的只是台美龐大貿易活動中的很小部分，希望台美穩固的友好合作關係不會因這一小問題而受影響。
他說：“現階段我們會持續跟美方做溝通，希望美方能夠了解到，(台灣)國內也有一些科學的檢驗規範。美國有很多的牛肉到台灣來，都沒有含有瘦肉精。院長(吳敦義)說，樂見不含瘦肉精的牛肉進來。”
自由時報說，美國在台協會（AIT）繼續將瘦肉精問題作為啟動有關TIFA(貿易暨投資架构協定)談判的先決條件，售台武器談判的延宕已為一些台灣立委關注。
黃介正是台灣淡江大學戰略研究所助理教授，他在談到美國立場時說，台灣改變協議承諾在先。
他說：“瘦肉精的問題是個很棘手的問題。美方關切的重點是，當初我們(台灣)就牛肉進口同美方簽署的協議，由於我們國內內部的壓力，國內修改了相關的法律，因此使得這個協議部分沒有辦法執行。所以站在美方的立場上講，這是我們單方面的作為影響到雙邊協議的執行。美國對此很在意。”
*黃介正﹕美國對此很在意 *
聯合報援引民進党立委陳瑩的話說，如果真的影響未來TIFA(貿易暨投資架构協定)談判、台美關係，外交和國人健康有所沖突時，台灣外交部該採取甚麼立場？
黃教授說，其實這是一個很無奈的問題。首先，台灣衛生署和農委會在瘦肉精殘留值問題上沒有統一認識。
另外，就台灣修改有關瘦肉精的標準和法規而言，黃教授說：“目前在國內，無論是國會，還是媒體，還是一般民眾，我們沒有公民支持的力度。所以對台灣來講，這個問題很大程度上就是一個僵局。另外，現在我們選舉很多，如果瘦肉精問題處理不當，執政當局在選舉時受到很大的責難，這也是政治人物不希望見到的情況。”
黃教授說，美台間的瘦肉精問題將因此會持續，打破僵局的因素目前尚不明朗，對台美關係的實際影響還有待觀察。
