台灣國防部週二（1月2日）表示，兩枚中國探空氣球元旦（週一）當晚逾越分割兩岸傳統的海峽中線，其中一枚氣球直接穿越台灣上空，橫穿中央山脈後離台出海。
台灣國防部公佈的一份示意圖顯示，兩枚氣球從海峽中線以西向東北方向平行漂移，北邊的那枚氣球沒有直接進入台灣的上空，但是南邊的一枚氣球則直接從台灣中部偏北的上空橫越，隨後兩枚氣球離開台灣進入西太平洋上空。
中國高空氣球穿越台灣上空之所以特別引入注目，是因為台灣即將在1月13日舉行新的總統和立委選舉，而誰將贏得大選不僅對台灣民眾很重要，而且對聲稱擁有台灣主權、即使 訴諸武力也要實現兩岸統一的北京當局也很重要。
台灣的民進黨政府一再指責北京以各種方式試圖幹預台灣的大選，包括政治影響和軍事恐嚇，並且持續向台灣選民喊話，呼籲台灣的選民在所謂“戰爭與和平”之間作出選擇，意 即投票給民進黨總統候選人賴清德就是選擇戰爭，而投票給主張與大陸加強對話和互動的在野黨則是選擇和平。
有人擔心，中國氣球飛越台灣上空恐怕也是對台灣選舉的一種干預手段，讓選民意識到中國政府及其政治主張的無遠弗屆。
台灣國防部週二也表示，在星期一早6點至星期二早6點的24小時內，一共發現四架解放軍軍機和三艘海軍艦艇出現在台灣週邊的海空域。
四架軍機中有一架空警-500預警機進入台灣西南防空識別區，但是沒有戰機逾越台海中線。
台灣軍方曾出動戰機、艦艇並啟動防空飛彈系統對解放軍機艦實施追蹤警戒。
隨著台灣大選的日益臨近，中國軍方對台灣施加的軍事壓力也有升高的跡象。
去年2月初，中國一枚高空偵察氣球入侵美國本土的領空，並在穿越美國大陸後遭到美軍擊落，此舉讓美中關係進一步惡化。 雙方經過了幾個月的努力與溝通，才逐漸恢復高層交往。
《新聞週刊》引述台灣當局的話說，穿越台灣天空的中國氣球很可能是用於氣候觀察的探空氣球，但是中方施放氣球的單位是誰、是民用單位還是軍事單位目前並不清楚。
新聞週刊引述專家稱，由於高空偵察任務目前基本上都是由衛星擔負，氣球可能只是收集台灣週邊的天文和地理資料，以便在未來某一天中國武統台灣時派上用場。
台灣國防部表示，兩枚中國高空氣球是分別在30,000英尺和32,000英尺的高空被發現的。 這基本上也是普通民航機的巡航高度。
中國政府尚未對台灣報告的氣球一事作出反應。 不過新聞週刊說，飛越台灣的氣球似乎跟去年2月飛越美國的氣球不大一樣。 中國將那枚氣球稱為進行氣候探測的無人飛艇，而且飛行高度在60,000至65,000英尺之間。
美國軍方在對氣球被擊落後打撈上來的殘骸進行分析後得出的結論是，氣球上配備了收集敏感情報的設備。
台灣大約一個月前對偵測到飛越台灣的中國氣球一事開始對外發布消息的。 台灣一位國防部發言人當時曾告訴新聞周刊，台灣這麼做是為了資訊透明化。
中國國家主席習近平在星期日發表的新年賀詞中曾表示，兩岸之間的統一「是歷史必然」。