台灣對中國處理冠狀病毒危機做法加大批評力度，稱中共看重其權力甚過其自己人民。但與此同時北京則表示，台北指稱大陸“隱瞞疫情”是無恥。
新冠病毒疫情在全球的大流行加劇了台灣和中國的敵對。中國認為台灣是其不可分割神聖領土的一部分，必要時可以使用武力統一。但台灣堅稱自己是個獨立的國家，不是中國的一個省。
台灣民進黨政府說，中國故意阻礙其從世衛組織直接獲取有關新冠病毒疫情信息的努力，並阻止台灣加入世衛組織。
台灣還對中國解放軍最近在台灣海峽周圍進行軍事訓練和演習表示不滿。
台灣行政院長蘇貞昌星期二（3月24日）指責中國在初期隱瞞疫情，沒有讓世界早一點能獲得警告。
台灣執政黨民進黨主席卓榮泰星期三再次提到中國隱瞞疫情並矇騙了世衛組織。他說：“中國從去年底疫情爆發開始，隱匿疫情、操控世界衛生組織粉飾太平、透過大外宣發動防疫外交等一連串作為，延續美中多方面的對抗，牽動全球及亞太區域安全及戰略情勢變化。”
他說：“中國政權以維穩至上，輕忽人民生命健康的作法，造成疫情擴散，使中國過去刻意營造的大國形象受到重創。”
中國強烈否認曾經掩蓋疫情，並向台灣承諾將向其提供抗擊疫情的有關信息。中國國台辦星期二發表聲明說，蘇貞昌公然造謠大陸“隱瞞疫情”，是藉製造謊言來煽動歧視和仇恨。截止到3月24日，大陸已經向台灣通報了101次有關疫情的情況。
中國國台辦發言人朱鳳蓮說：蘇貞昌“借疫情不斷‘點火’升高兩岸對立，惡化兩岸關係氣氛，既無恥又令人厭惡。”
在疫情初期，台灣加大了對入境人員的檢查，並禁止大部分大陸訪客入境。在嚴厲的防疫措施下，台灣沒有發生社區傳染，贏得了專家的讚譽。不過，在過去的一周，隨著來自歐洲和美國的返台人數的增加，台灣的境外輸入病例在增加，3月25日新增19例境外輸入病例。目前台灣確診病例為235例。死亡兩例。
