台灣經濟部工業局副局長呂正華
台灣經濟部表示，雙方經貿關係進入一個新的里程碑，這個協議將幫助台灣和日本電機電子產品出口商降低驗證成本，提升台灣在日本和東北亞市場的競爭力。台灣政府表示，台灣和日本自從去年簽署投資協議後，日本到台灣的投資有所增加。經濟部工業局副局長呂正華介紹今年台灣和日本投資狀況﹕“2012年1月到10月，日本對台灣的投資是100億台幣，就是3.87億美元，在同時期，台灣對日本投資是10.82億美元，超過日本對台灣投資金額2.8倍左右。”呂正華表示，日本對台灣的投資比去年增長了15%，而且投資件數大幅昇高40%。
在此之前一天，台灣總統馬英九在和大橋光夫進行會晤時表示，希望台灣和日本未來能簽署“避免雙重課稅”等相關經貿協定，協助雙方企業投資，並探討簽訂自由貿易協定或經濟合作協定等議題，深化雙方經貿關係。
在上星期落幕的東亞峰會上，中國、日本、南韓宣佈明年啟動自由貿易協定談判。
亞東關係協會會長廖了以
在簽署兩項經貿協議後，台灣和日本將在星期五於東京舉行釣魚島週邊海域漁業權的漁業談判預備磋商，這被許多媒體視為繼釣魚島主權爭議後台日恢復友誼的重要會談。台灣媒體報導說，這次磋商將會擱置釣魚島爭議，磋商議題為設定台灣漁船的捕撈水域，製定防止過度捕撈措施等。台日漁業談判已經從2009年2月中斷到現在。亞東關係協會會長廖了以表示，最近一系列的台日經貿交流和緩和釣魚島局勢無關。他說﹕“我們努力各項MOU，如何能簽的話我們就大膽努力去簽，我想時間剛好碰在一起，毫無關係。”