第六次江陳會在星期三(22號)結束，雙方僅簽訂兩岸醫藥合作協議，並將成立協議落實的檢討機制，但在經濟合作方面仍無法達成共識。海基會(海峽交流基金會)與海協會(海峽兩岸關係協會)在21號下午簽署了“兩岸醫藥合作協議。”
海協會副會長鄭立中認為兩岸醫藥衛生合作協議的簽訂，是“兩會協商向社會文化領域擴展”，他期許明年能盡快針對這方面開啟談判。
鄭立中說﹕“建議兩會進一步豐富談判協商的議題，照顧兩岸同胞多方面的需求，盡快啟動兩岸科技、文化、教育等議題的協商。”
台灣衛生署副署長蕭美玲說，兩岸之間互動頻繁，所以交換傳染病監測資料，互相通報十分重要。此外，該協議也更能管制醫藥品劣品，特別台灣坊間的中藥材九成來自中國，雖然目前已有品質管制，但未來能夠更好的管理。
蕭美玲說：“在大陸方面輸出之前，就能夠做一些檢驗，也提供檢驗的證明。也就是說讓中藥材的進口，在進口之前，在境外就已經多了一層把關。”
而在生技產業方面，雙方同意對於新要與新的醫療器材，將採取國際標準進行多次的臨床與非臨床試驗。
*將成立制度檢查落實情況*
台灣海基會董事長江丙坤提到，將針對過去簽署的14項協議的實行成效，進行落實檢討。
江丙坤說：“雙方也同意，來舉行兩岸協議成效檢討會議，也就是將來由雙方的副會長，就重要的議題，率領相關部會的負責單位，作商入的探討。”
鄭立中則認為，過去協議在落實方面之所以產生問題，多半是由於技術層面，未來兩會將合作解決。
*兩岸經合協議無時間表*
不過從第五次江陳會就決定納入重點的兩岸投資保障協議，在本次會議中卻沒有定論。
陳雲林(左)與江丙坤(右)交換簽訂之協議
鄭立中解釋，投保協議是依照兩岸經濟協議而成立的，本次江陳會雙方已就幾項內容達成共識，包括“建立投資保障機制”、“提高投資相關規定的透明度”、“逐步減少雙方相互投資限制”，及“促進投資便利化”。
至於雙方分歧部份，鄭立中說：“有分歧在哪裡，我也可以說。雙方討論了並且還將繼續討論，投資和投資的定義、投資待遇、投資便利、徵收、損害賠償，和損失的補償等等。”
江丙坤和陳雲林都公開表示，投資保障協議將成為第七次江陳會主要議題。不過此前江丙坤曾說過，若沒有協議可簽，半年後將不會召開第七次會議。江丙坤在會談之後表示，還是希望能夠在明年舉辦。
江丙坤說：“我們期望這個協議能夠完成之後，所以時間能做調整，是這個意思。原則上維持一年兩次輪流舉辦，但是時間、地點我們希望保持彈性，這方面陳雲林會長也同意。”
受到矚目的兩岸經濟合作會議(經合會)，鄭立中認為在技術上兩岸已達成一定共識，海基會副董事長高孔廉也說，經合會是功能性的非常態會議，將不會有固定的辦公室與成員，但期望在近期之內能夠召開。
民進黨主席蔡英文22號要求所有的決議以及方案都應送交國會審查，接受民意的監督。
陳雲林於22日上午參訪台北市花卉博覽會，刻意避開人潮，比開園時間提早一小時入場。園區現場有中華民國國旗，不過陳雲林未回答媒體看到中華民國國旗感受的問題。海協會代表團在下午搭機返回北京。