菲律賓外交部週二（12月12日）表示，已召見中國駐馬尼拉大使，抗議中國海警船週末在南中國海對菲律賓船隻進行的“接連騷擾”。其發言人稱，宣布中國駐菲律賓大使黃溪連為“不受歡迎的人”也是“必須認真考慮的事情”。不過，中國駐菲律賓大使館發表聲明稱，黃溪連大使“就菲方近日在黃岩島和仁愛礁附近海域侵權挑釁向菲方提出嚴正交涉和強烈抗議”。
菲律賓外交部在聲明中表示，馬尼拉已要求中國指示其船隻停止針對菲律賓船隻的非法和危險動作，並停止幹預菲律賓的合法活動。
菲律賓外交部副部長特蕾莎·拉扎羅（Theresa Lazaro）當面向黃溪連大使抗議中國導致碰撞的操作，並抗議中國船隻使用高壓水砲襲擊菲律賓的補給船。當時這艘菲律賓補給船正在向坐灘第二托馬斯淺灘“中國稱仁愛礁”上一艘老舊軍艦上的駐軍運送物資。
菲律賓外交部表示：“中國船隻在菲律賓專屬經濟區內的行為是非法的，侵犯了航行自由。”菲律賓也抗議中國使用水砲射擊三艘漁業局的船隻，這些船隻正在向斯卡伯勒淺灘“中國稱為黃岩島”附近的漁民運送石油和雜貨。
法新社的報道稱，菲律賓外交部發言人特雷西塔·達扎(Teresita Daza)在周一的新聞發布會上表示，除向中國方面提出外交抗議，“召見中國大使”以外，宣布中國駐菲律賓大使黃溪連為“不受歡迎的人”也是“必須認真考慮的事情”。
中國駐馬尼拉大使館沒有立即回應路透社的置評請求。
不過，中國駐馬尼拉大使館12月11日發表聲明稱，黃溪連大使在會見菲律賓外交部副部長拉扎羅時，“就菲方近日在黃岩島和仁愛礁附近海域侵權挑釁向菲方提出嚴正交涉和強烈抗議。”
聲明說，黃岩島和仁愛礁是中國固有領土，擁有主權權利和管轄權，“中方敦促菲方停止海上侵權挑釁行為，……共同維護南海和平穩定。”
菲律賓星期一（12月11日）指控中國海警船週末在有主權爭議的南中國海撞擊和用水砲騷擾菲律賓執行補給任務船隻的行為是「嚴重的升級」。
路透社報道說，馬尼拉指責中國海警和海上民兵多次向菲律賓補給船發射水砲，造成其中一艘的“發動機嚴重損壞”，並“故意”撞擊另一艘補給船。
菲律賓武裝部隊總參謀長羅密歐·布勞納（Romeo Brawner）表示，他當時就在其中一艘被發射水砲又被撞擊的船上。
菲律賓國家安全委員會發言人、助理總幹事喬納森·馬拉亞（Jonathan Malaya）在新聞發布會上說，“這是中華人民共和國方面的一個嚴重升級行為。”
不過，中國外交部發言人毛寧在週一的例行記者會上說，12月10日，菲律賓一艘運補船、一艘公務船和兩艘海警船未經中國政府允許，擅自闖入中國南沙群島仁愛礁鄰近海域，企圖向仁愛礁非法「坐灘」的軍艦運送建築資。
菲律賓的條約盟友美國以及英國都表示支持菲律賓，並譴責中國的行為。美國國務院週日呼籲中國停止在海上「危險和破壞穩定」的行動。美國國務院發言人馬修米勒（Matthew Miller）12月10日批評中國幹預菲律賓的海上行動並破壞地區穩定，敦促北京停止在南中國海“危險和破壞穩定的行為”。
美國國務院的聲明表示，12月9日和10日在南中國海具爭議的淺灘，「中華人民共和國船隻使用了水砲和魯莽的行動，包括強行碰撞，對前往這些地點執行官方補給任務的菲律賓船隻造成損害，危及菲律賓船員的安全。”
英國外交部週一（12月11日）就南海衝突事件發表聲明，譴責中國船隻12月9日和10日在南中國海針對菲律賓採取的「不安全且導致局勢升級的行為」。
英國外交部在一份聲明中表示：“英國反對任何加劇緊張局勢的行動，包括騷擾、不安全行為和恐嚇策略，這些行為會增加誤判風險並威脅地區和平與穩定。”
法新社引述分析人士的話說，週末菲律賓和中國船隻之間的對抗是多年來最激烈的，並預測緊張局勢將會升級。
分析家、前中國軍方軍官宋忠平表示，美國對菲律賓的支持讓馬尼拉感到“有勇氣挑釁中國”，加劇了緊張局勢。而新加坡南洋理工大學助理教授兼軍事專家 Michael Raska表示，中國的行動“不僅是為了恐嚇和脅迫菲律賓接受中國的領土主張，而且更有可能考驗美國的決心”。
中國聲稱對幾乎整個南中國海擁有主權。南中國海是每年超過價值3兆美元商船的通道。菲律賓、越南、印尼、馬來西亞和汶萊都宣稱對南海部分海域擁有主權。
海牙常設仲裁法院2016年表示，中國對南海大部分海域的主權主張沒有法律依據。