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印尼在捍衛海洋主權的同時與中國發展經濟關係
雖然印尼高調宣稱將在周邊水域巡邏驅逐中國漁船，而這將危及兩國的經貿關係，但分析人士指出，但目前為止，印尼最終在這一輪爭議中上佔了上風而且沒有帶來什麼負面的後果。
印尼總統佐科10月份表示，他的政府永遠不會對納土納群島的主權問題做出讓步。納土納群島位於婆羅洲的西北側，由272個微型島嶼組成，它附近水域有中國船隻經過。 9月和10月軍事演習期間，佐科到訪了這座群島。
澳大利亞墨爾本大學亞洲研究中心的高級研究員大衛·麥克雷說：“一些印尼官員堅定的認為，印尼既可以堅持對它主張的納土納群島周圍的專屬經濟區享有權利，與此同時也能夠與中國發展穩固的經濟聯結。”
佐科去年還呼籲印中兩國到2020年時將雙向貿易額提高到1500億美元。中國已經是印尼的首要進口來源和礦產及棕櫚油等產品的第二大出口目的地。
但印尼內閣已經實施了被專家稱為低風險的策略，來捍衛它主張的納土納群島周圍200海裡的專屬經濟區。中國援引歷史資料表示，中國漁船數年來一直在這片水域捕魚。
國內的擔憂
印尼人民特別是漁民們憎惡非法捕魚。由於之前對印尼的一萬三千個島嶼周圍水域的監管缺失，非法捕魚已經成為了一個問題。
印尼總統表示，印尼自己應該獲得納土納群島附近的漁業和天然氣資源。
中國主張對南中國海95%的海域（350萬平方千米）享有主權，面積從臺灣延伸至新加坡，其中包括納土納群島附近的一片水域。
中國的主張還侵犯了汶萊、馬來西亞、越南和菲律賓建立的專屬經濟區。從2010年起，中國開始在西沙和南沙群島填海造陸，並向那裡運送軍事設施和建造石油鑽塔，以強化其主權主張。台灣也主張對南中國海的大部分地區享有主權。南中國海是亞洲地區深遠的主權爭議的中心問題。